Jarl was getrouwd met Klara Geertruida Aletta van den Ende. Na zijn studie geneeskunde werd hij huisarts in Ee.

Tijdens de Tweede Wereldoorlog heeft deze huisarts uit Ee veel Joodse mensen aan een onderduikadres geholpen in Oost-Dongeradeel. Wegens zijn verzetsactiviteiten werd hij opgepakt. Dokter Ruinen is één van de twintig mannen die op
22 januari 1945 aan de Woudweg in Dokkum door de Duitsers werd geëxecuteerd.
Uit wraak voor de overval op 19 januari 1945 in De Falom, waarbij een hoge Duitse officier gedood werd door verzetsstrijders.
Toen dokter Ruinen voor het vuurpeloton stond zei hij: ‘spaar dit kind’. Hij doelde daarbij op de 23-jarige Geale Postma uit Driezum die vlak na hem werd doodgeschoten.
Voor veel dorpsgenoten was dokter Ruinen een held. Na de oorlog prijkte zijn foto bij menig ‘Jister’ op de schoorsteenmantel. Zijn zoon Luuk, die een paar jaar geleden is overleden, zag zijn vader naar eigen zeggen niet als een held. ,,Ik had hem liever zelf bij me gehouden.
Ik was mijn vader kwijt en dat gemis is gebleven”, zei hij. Door de dood van zijn vader heeft hij levenslang gekregen.

Zijn naam staat, samen met die van de 19 lotgenoten, vermeld op het monument aan de Woudweg in Dokkum.

Op het kerkhof rond de ‘tsjerke op ‘e terp’ staat een monument ter nagedachtenis van dokter Jarl Ruinen.