Jan Bart maakt op 18 april 1944 deel uit van het grote transport dat vanuit Amersfoort onderweg gaat naar K.L. Buchenwald. Met 496 andere lotgenoten zou aanvankelijk de bestemming Rheine worden om daar aan het vliegveld te werken. Omdat men kennelijk niet op een dergelijk groot aantal gevangenen had gerekend, wordt het transport doorgestuurd naar K.L. Buchenwald, waar het op 19 april 1944 arriveerde.

Jan Bart Schijffelen wordt daar geregistreerd onder Haftlingnummer 47405. Tijdens het geallieerde bombardement van 24-8-1944 op de Gustloff-Werke waarbij K.L. Buchenwald ook wordt getroffen komt Jan Bart Schijffelen om het leven.