Als soldaat bij 14 Regiment Infanterie heeft Toon Bouwens zich op 8 juli 1943 moeten melden in de Waterlookazerne te Amersfoort, ten einde te worden teruggevoerd in krijgsgevangenschap. Het is niet bekend waarom hij zich niet heeft gemeld. Mogelijk is hij op dat moment ondergedoken. Op 5 augustus 1943 arriveerde hij alsnog in Amersfoort en werd kort daarop afgevoerd naar Stalag IV-b Mühlberg, waar hij op 9 augustus 1943 binnenkwam en het krijgsgevangenennummer 98249 ontving. Op 27 augustus 1943 werd hij met hartklachten opgenomen in het Lazarett van Mühlberg, waar hij op 3 september 1943 overleed.

Toon Bouwens werd in eerste instantie begraven op de krijgsgevangenenbegraafplaats in Neuburxdorf, graf 424. Zijn stoffelijke resten werd na de oorlog overgebracht naar het Ereveld in Loenen vak D nr. 422.