Johannes Klingen is samen met zijn naaste medewerker Henk Schoenmaker gefusilleerd (mogelijk) op de Waalsdorpervlakte in Wassenaar. Hun stoffelijke overschotten zijn destijds niet in de duinen begraven, maar overgebracht naar het Crematorium Velsen in Driehuis. Daar zijn de lichamen dezelfde dag gecremeerd en geborgen in urnen met nummers 12831 en 12832. Deze urnen zijn direct na de crematie overgedragen aan de Duitse Inspektor H. Nowottnick uit Utrecht. Wat die met de asbussen heeft gedaan, is helaas onbekend.